H λοίμωξη του κορωνοϊού στην Κύπρο είναι πολυφυλετική, αφού έχουν εντοπιστεί 37 διαφορετικές γενεαλογίες του ιού.
Σύμφωνα με έρευνα του Εργαστηρίου Βιοτεχνολογίας και Μοριακής Ιολογίας του Πανεπιστημίου Κύπρου, εκ των ερευνητικών προγραμμάτων του καθηγητή Λεόντιου Κωστρίκη, το στέλεχος Β.1.258 είναι το επικρατέστερο στην Κύπρο και τους τελευταίους μήνες αγγίζει το 90% των μολύνσεων.
Σύμφωνα με τα ευρήματα της έρευνας, το συγκεκριμένο στέλεχος έχει παρόμοιες μεταλλάξεις με το αγγλικό στέλεχος Β.1.1.7, οι οποίες αυξάνουν τη μεταδοτικότητα του ιού και την ικανότητά του να αντιστέκεται στο ανοσοποιητικό σύστημα.
Το στέλεχος εισήχθη στην Κύπρο από τη Σουηδία, το Ηνωμένο Βασίλειο, τη Σλοβενία και τη Δανία.
Η φυλογεωγραφική ανάλυση δεικνύει, επίσης, ότι το συγκεκριμένο στέλεχος εξάγεται από την Κύπρο στο Ηνωμένο Βασίλειο, την Τσεχία και τη Δανία.